种族灭绝和种族隔离之间的联系从未得到裁决。南非宪法法院曾偶尔指出“种族隔离的做法构成了反人类罪，种族隔离政府的某些做法构成了战争罪”。宪法法院没有探讨种族灭绝和种族隔离之间可能存在的联系，但有人认为种族隔离国家的一些政策和行为（例如化学和生物武器计划及其反生育研究）可以被解释为种族灭绝阴谋。2023年，南非历史性的首次种族隔离审判开始，涉及两名被指控在 1980 年代初绑架和谋杀反种族隔离学生团体成员的个人。
据称，被告犯下这些罪行是为了维护种族隔离制度
起诉是基于习惯国际法下 墨西哥区号 种族隔离罪。基于习惯进行起诉从合法性角度来看具有挑战性，但由于南非不是《种族隔离公约》的缔约国，且缺乏涵盖所指控行为时间范围的犯罪法定条款，起诉的唯一出路就是依靠习惯。无论如何，有人认为《种族隔离公约》中对种族隔离的定义确实为习惯上 峰会通过实践研讨会 的种族隔离禁令和《消除一切形式种族歧视国际公约》第 3 条中的禁令提供了内容。将针对被指控的前安全官员的案件构建为种族灭绝罪会更加困难。事实上，起诉书更符合将种族隔离构建为危害人类罪的说法，正如《罗马规约》第 7 条所言，而不是作为一种种族灭绝形式。
当然，国际法院的申请并不是在刑事审判中为了追究个人刑事责任而对特定个人提出的起诉。它涉及条约制 巴西号码列表 度下的国家责任，涉及以色列国通过其代理人在种族隔离和占领背景下的行为和煽动。目的（意图）的构建方式允许对个人行为进行分析，
只要人们可以将他们的行为归咎于国家
如果个人代理人的行为具有必要的意图，例如，全部或部分摧毁受保护群体（种族灭绝）或维持种族统治制度（种族隔离），则有关国家将承担责任。正如迈尔斯·杰克逊正确指出的那样，特定代理人可以出于多种目的行事。